化学信息学的开源工具包

RDKit是一个用于化学信息学的开源工具包，基于对化合物2D和3D分子操作，利用机器学习方法进行化合物描述符生成，fingerprint生成，化合物结构相似性计算，2D和3D分子展示等。将化学与机器学习联系起来的、非常实用的库。可以在很多种化学文件如mol2，mol，Smiles，sdf等之间互相转化，并能将其展示成2D、3D等形式供开发人员使用。

例子包括

• 读写分子
• 图片生成 & 保存
• 特征提取 & 分子相似性计算 相似度计算给出了三种计算方式的例子。

运行例子 - SimpleSmilesExample

运行成功后，命令行应该看到下面的信息:

​x
[INFO ] - smi1: c1ccccc1
[INFO ] - smi2: c1ccccn1
[INFO ] - AllBitSimilarity: 0.98681640625
[INFO ] - CosineSimilarity: 0.4147806778921701
[INFO ] - DiceSimilarity: 0.5454545454545454

保存分子图片：

Git地址：

Github链接
Gitee链接